KNCV logo KNCV logo
Zoeken

Gouden Spatel 2019

Winnaar Gouden Spatel 2019

Werner Tabak

Fragment Based Lead Discovery: Design and Synthesis of Arginase 1 Inhibitors, Avans Hogeschool

De jury van de Gouden Spatel heeft dit jaar de scriptie van Werner Tabak, geschreven in het kader van zijn hbo opleiding ‘Food and Pharma’ aan de Avans Hogeschool, genomineerd voor de Gouden Spatel 2019.

Werner beschrijft in zijn scriptie het onderzoek dat hij heeft uitgevoerd bij het Netherlands Translational Research Center in Oss. Het onderzoek betreft de 11-staps-synthese van een alifatisch boorzuur, en de syntheses van daarop gemodelleerde fragmenten. Dit boorzuur is in een patent beschreven als een arginase 1 inhibitor en het NTRC heeft de techniek in huis om het eiwit arginase 1 te kristalliseren. Als dit gebeurt in aanwezigheid van het boorzuur of van één van de fragmenten kan binding worden gevisualiseerd en wordt informatie verkregen over de interacties tussen inhibitor en eiwit. Remming van arginase I is een veelbelovende strategie in de behandeling van o.a cardiovasculaire ziektes.

In een korte, heldere introductie laat Werner de relevantie van het onderzoek zien en legt hij de keuze voor de fragmenten uit. De te gebruiken reacties worden helder en bondig toegelicht, waarna de onderzoeksresultaten grondig worden beschreven. In 11 stappen die een staalkaart laten zien van moderne organische chemie maakt Werner het boorzuur in een totaalopbrengst van 5.4%. Dit is geen eenvoudige taak, omdat de verbinding polaire groepen bevat, die de zuivering bemoeilijken. Daarnaast beschrijft hij de keuze van acht fragmenten en de daaropvolgende syntheses en de (2D) NMR en MS analyses van deze fragmenten, waarvan ook een aantal zeer polaire groepen bevatten.

Na de resultaten van de eiwitkristallisaties en van de biologische testen te hebben besproken trekt Werner conclusies over de benodigde eiwit-ligand interacties en doet voorstellen voor verder onderzoek en rond het verslag daarmee passend af.

Het verslag is verzorgd, voorzien van mooie illustraties en de beschrijving van de experimenten is van hoge kwaliteit. Daarbij maakt hij op een uitstekende wijze gebruik van de literatuur. Het hoge niveau van het onderzoek wordt bevestigd door de dagelijkse begeleider van Werner en de stagebegeleider. Bovendien wordt een gedeelte van het onderzoek binnenkort gepubliceerd in een wetenschappelijk tijdschrift.

Aan de hand van voornoemde feiten heeft de selectiecommissie geconcludeerd dat Werner een uitstekende kandidaat is voor nominatie voor de eerste plaats van de Gouden Spatel 2019.

De andere twee prijzen zijn toegekend aan:

Anouk Bosman - Hogeschool van Arnhem en Nijmegen
Microdevices with Macro Impact

Kielen Zuurbier - Hogeschool Utrecht
Development of a Novel Chemogenetically Inducible Gene Expression System for Controlled BDNF Overexpression by Endogenous B-cells as a Stroke Therapeutic